Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp3P63024 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms