Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap1s1P61967 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s1P61967 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap1s1P61967 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms