Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2fP61219 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms