Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem258P61166 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms