Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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