Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NrlP54846 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NrlP54846 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NrlP54846 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NrlP54846 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NrlP54846 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NrlP54846 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrlP54846 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms