Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb3P54754 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms