Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms