Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RorcP51450 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RorcP51450 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RorcP51450 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RorcP51450 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RorcP51450 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RorcP51450 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RorcP51450 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RorcP51450 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RorcP51450 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RorcP51450 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RorcP51450 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RorcP51450 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RorcP51450 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RorcP51450 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RorcP51450 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RorcP51450 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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