Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms