Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3aP47708 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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