Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Msh2P43247 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Msh2P43247 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msh2P43247 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msh2P43247 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msh2P43247 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msh2P43247 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msh2P43247 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msh2P43247 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msh2P43247 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msh2P43247 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msh2P43247 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msh2P43247 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msh2P43247 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msh2P43247 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msh2P43247 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh2P43247 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh2P43247 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msh2P43247 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms