Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms