Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Saa4P31532 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms