Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cd28P31041 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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