Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Marcksl1P28667 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms