Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms