Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc5P27641 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms