Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms