Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms