Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms