Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

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Length 679 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fv4P11370 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fv4P11370 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fv4P11370 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fv4P11370 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fv4P11370 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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