Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatspereP0DP43 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms