Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms