Protein–RNA interactions for Protein: P09023

Hoxb6, Homeobox protein Hox-B6, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb6P09023 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb6P09023 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb6P09023 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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