Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ClppO88696 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClppO88696 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClppO88696 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClppO88696 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ClppO88696 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClppO88696 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClppO88696 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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ClppO88696 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClppO88696 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClppO88696 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClppO88696 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClppO88696 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClppO88696 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClppO88696 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClppO88696 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClppO88696 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ClppO88696 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClppO88696 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClppO88696 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClppO88696 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClppO88696 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClppO88696 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClppO88696 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClppO88696 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ClppO88696 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ClppO88696 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ClppO88696 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClppO88696 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ClppO88696 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClppO88696 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ClppO88696 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClppO88696 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ClppO88696 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ClppO88696 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ClppO88696 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClppO88696 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClppO88696 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClppO88696 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ClppO88696 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ClppO88696 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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