Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SlkO54988 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SlkO54988 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SlkO54988 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SlkO54988 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SlkO54988 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SlkO54988 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SlkO54988 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SlkO54988 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SlkO54988 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SlkO54988 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SlkO54988 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SlkO54988 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SlkO54988 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SlkO54988 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlkO54988 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlkO54988 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlkO54988 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlkO54988 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlkO54988 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlkO54988 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlkO54988 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlkO54988 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlkO54988 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SlkO54988 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlkO54988 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlkO54988 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SlkO54988 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlkO54988 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlkO54988 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlkO54988 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlkO54988 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlkO54988 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlkO54988 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlkO54988 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SlkO54988 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms