Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms