Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DffbO54788 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffbO54788 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffbO54788 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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