Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timm44O35857 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms