Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms