Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ColqO35348 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ColqO35348 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ColqO35348 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ColqO35348 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ColqO35348 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ColqO35348 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ColqO35348 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ColqO35348 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ColqO35348 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ColqO35348 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ColqO35348 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms