Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casq1O09165 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casq1O09165 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casq1O09165 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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