Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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