Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmgcF6VRN1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms