Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6133B2RY53 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms