Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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