Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms