Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek4Q9Z1J2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms