Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Cldn13Q9Z0S4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Cldn13Q9Z0S4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Cldn13Q9Z0S4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Cldn13Q9Z0S4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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