Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sorbs3Q9R1Z8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms