Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rnf4Q9QZS2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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