Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Exo1Q9QZ11 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Exo1Q9QZ11 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Exo1Q9QZ11 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Exo1Q9QZ11 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Exo1Q9QZ11 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Exo1Q9QZ11 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Exo1Q9QZ11 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Exo1Q9QZ11 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Exo1Q9QZ11 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms