Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod4Q9JLH8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms