Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms