Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms