Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn19Q9ET38 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn19Q9ET38 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn19Q9ET38 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn19Q9ET38 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn19Q9ET38 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn19Q9ET38 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn19Q9ET38 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn19Q9ET38 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn19Q9ET38 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn19Q9ET38 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn19Q9ET38 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn19Q9ET38 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cldn19Q9ET38 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cldn19Q9ET38 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn19Q9ET38 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn19Q9ET38 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn19Q9ET38 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn19Q9ET38 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms