Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmg20aQ9DC33 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms