Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calr3Q9D9Q6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calr3Q9D9Q6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calr3Q9D9Q6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calr3Q9D9Q6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calr3Q9D9Q6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calr3Q9D9Q6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calr3Q9D9Q6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Calr3Q9D9Q6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Calr3Q9D9Q6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Calr3Q9D9Q6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Calr3Q9D9Q6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Calr3Q9D9Q6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Calr3Q9D9Q6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Calr3Q9D9Q6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Calr3Q9D9Q6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Calr3Q9D9Q6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Calr3Q9D9Q6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Calr3Q9D9Q6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Calr3Q9D9Q6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Calr3Q9D9Q6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calr3Q9D9Q6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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