Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms